剧情简介

从外宇宙出现的神秘的光向地球前进。这个光球飞行物经过的各行星的前线基地的通信一个接一个地中断，并且光球飞行物急速接近地球，地球方面用迎击导弹应战也没有效果，悠然降落在地球上的是超大型导弹。然后地球舰队被后来涌向地球的大舰队的奇袭攻击所毁灭，地球瞬间被压制。
ϗ黑暗星团帝国要求显示大和的所在地，威胁说超大型导弹是重核子炸弹，破坏地球的中间子质量，可以一举消灭人类的脑细胞。
古代达大和的船员们集结在英雄的山丘上，接受了森雪带来的地球防卫军长官的绝密命令，前往小行星伊卡洛斯。但是森雪在途中受伤，只有一个人被留在了地球上。从地球上实现了决死逃脱的一行人到达伊卡洛斯后，那里隐藏着大和。
大和的船员们发现重核子炸弹的起爆控制是敌母星，为了阻止爆炸，踏上了40万光年的航海之旅。